Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDF4Q9BRK5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms