Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RETNLBQ9BQ08 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms