Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RNF5Q99942 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms