Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP88Q99567 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms