Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
JMJD8Q96S16 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms