Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC38A2Q96QD8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC38A2Q96QD8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms