Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP4Q96PP9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP4Q96PP9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms