Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SAMD8Q96LT4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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