Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF185Q96GF1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms