Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDX11Q96FC9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX11Q96FC9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms