Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3DQ96BQ1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3DQ96BQ1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms