Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMIGD2Q96BF3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms