Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPSB1Q96BD6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms