Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SH3KBP1Q96B97 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms