Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UTP4Q969X6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms