Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX21Q969T3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX21Q969T3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms