Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSMEM1Q8WWF3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms