Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC12Q8WUD4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC12Q8WUD4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms