Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYRIPQ8NFW9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms