Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC197Q8NCU1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms