Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
WDR53Q7Z5U6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
WDR53Q7Z5U6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms