Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT27Q7Z3Y8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms