Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE3BQ7Z3V4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE3BQ7Z3V4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms