Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNA2D4Q7Z3S7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms