Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
STRCQ7RTU9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STRCQ7RTU9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms