Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTOP1Q7RTM1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms