Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP31Q70CQ4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP31Q70CQ4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms