Protein–RNA interactions for Protein: Q709C8

VPS13C, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 3,753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13CQ709C8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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VPS13CQ709C8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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VPS13CQ709C8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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VPS13CQ709C8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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VPS13CQ709C8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VPS13CQ709C8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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