Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD6Q6ZV73 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FGD6Q6ZV73 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms