Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF493Q6ZR52 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms