Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIGD1Q6UXZ0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms