Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
C16orf54Q6UWD8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
C16orf54Q6UWD8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms