Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED9Q6R2W3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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