Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms