Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms