Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ANKRD40Q6AI12 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD40Q6AI12 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms