Protein–RNA interactions for Protein: Q68D10

SPTY2D1, Protein SPT2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTY2D1Q68D10 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPTY2D1Q68D10 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms