Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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CACHD1Q5VU97 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CACHD1Q5VU97 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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