Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EFHC1Q5JVL4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
EFHC1Q5JVL4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms