Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM259Q4ZIN3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms