Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL38Q2WGJ6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL38Q2WGJ6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms