Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2B3Q16720 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms