Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NRF1Q16656 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms