Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SGCAQ16586 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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SGCAQ16586 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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SGCAQ16586 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SGCAQ16586 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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