Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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