Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS72Q15906 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS72Q15906 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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