Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
USF2Q15853 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
USF2Q15853 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
USF2Q15853 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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