Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CHRNA2Q15822 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHRNA2Q15822 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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