Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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NCOA1Q15788 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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NCOA1Q15788 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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NCOA1Q15788 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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NCOA1Q15788 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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NCOA1Q15788 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
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NCOA1Q15788 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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NCOA1Q15788 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
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NCOA1Q15788 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
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NCOA1Q15788 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NCOA1Q15788 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NCOA1Q15788 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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