Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYCP1Q15431 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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